Osnova sekce

  • Přednáška je zaměřena na historický vývoj počítačové chemie, současné přístupy Drug Design & Discovery včetně in silico metod. Jsou zde vysvětleny základní metody těchto přístupů.

    • Pojmy k zapamatování

      • počítačem podporovaný design léčiv (CADD), pojmy "hit" a "lead", vysokovýkonný screening (HTS), virtuální screening (in silico, HTVS)
      • molekulová mechanika versus kvantová mechanika
      • princip výpočtů energií v molekulové mechanice
      • design léčiv založený na struktuře (SBDD) versus design léčiv založený na ligandu (LBDD)
      • röntgenová krystalografie, homologní modelování
      • farmakoforové modely, prohledávání pomocí farmakoforových modelů
      • využití fragmentů (fragment-based lead discovery)
      • energetická minimalizace, konformace, silové pole (force field)
      • molekulová dynamika