Section outline

◄Přednáška 7 / Lecture 7
►Seminář 2

    • Znalosti a dovednosti:

      Příprava malé molekuly - ligandu

      1. Kontrola struktury – chyby, vazby, apod.
      2. Volba protonace a/nebo tautomeru
      3. Kontrola stereochemických aspektů, R/S, cis / trans.
      4. Výpočet parciálních nábojů (dle zvoleného silového pole).
      5. Energetická minimalizace dle zvoleného silového pole (Force Field).
    • cox-2-inhibitors-pdb-smiles.smi File
    • Seminář 1 File
    • Seminar 1 ENG File
    • Video záznam online semináře 1 a 2 URL

    • Příprava na seminář

      Stáhněte si návody a tutoriály k software MOE. Viz níže. Projděte si:

      Tutorials

      • Prepare a Small Molecule
      • Prepare a Small Molecule Dataset
    • MOE - Reference and Tutorials URL

      Odkazuje na archiv (ZIP) ve studijních materiálech. Použití: Stáhnout (vyžaduje přihlášení přes fakultní login), rozbalit a ve složce html otevřít soubor index.html. Povolit obsah (jinak bude nefunkční vyhleddávání).

◄Přednáška 7 / Lecture 7
►Seminář 2