Ex3-Hint

• Use any domain prediction program like SMART or CD.
• Using BLAST (protein) you can search similar sequences (and verify the predicted function).

Při zadávání si zkontrolujte zda nemáte "omezené" hledání jen na člověka - pole by mělo zůstat prázdné a pro hledání organismu z jakého neznámá sekvence pochází je nutné prohledávat databázi "non-redundant protein sequences"

When entering the sequence check if you don ´t have "limited" search only to humans - the field should remain empty and to search for the organism from which the unknown sequence originates it is necessary to search the database "non-redundant protein sequences"

The organism from which this sequence originates will have a 100% identical sequence (it will be the first reference).

• Tranmembrane helices can be found using any of the proposed programes e.g. TMHMM.

Solution.