DÚ5: Vyhledávání nukleotidových sekvencí
Požadavky na absolvování
Otevřené: pondělí, 11. března 2024, 17.00
Termín: středa, 27. března 2024, 17.00
1)Vyhledejte si vaši nukleotidovou sekvenci transkriptu (mRNA=RefSeq_transcript) a genu (RefSeq_gene).
◦Zapište si přístupové kódy. (NM_... a NG_...)
◦Jak dlouhé jsou tyto sekvence ? (stačí 1. transkript, máte-li více)
2)Vyberte pouze kódující sekvenci (CDS), uložte formát fasta.
3)Na kterém chromozomu leží? Kolik má exonů? Jak je dlouhý 2. exon? Stáhněte sekvenci 2. exonu.
4)Obsahuje 2.exon nějaké významné varianty (SNP)?
5)Kolik obsahuje 2. exon Cytosinů? Kolik dinukleotidů CG?