Expasy je portál umožňující vstup do různých vědeckých databází a nástrojů z oblasti genomiky, proteomiky, systémové biologie atd.
Uniprot je proteinová databáze obsahující ručně anotované záznamy v rámci Swiss-Prot databáze a automaticky anotované záznamy v rámci TrEMBL databáze. Anglický detailní průvodce:
"National Center for Biotechnology Information protein" je databáze obsahující aminokyselinové sekvence z mnoha zdrojů, umožňující vyhledávání na základě textových zadání (zkratek, přístupových kódů, celých názvů proteinů).
SMS suite: jednotlivé nástroje pro výpočet různých vlastností proteinové sekvence (Molekulová hmotnost, Izoelektrický bod, Statistika AMK složení, Výběr části proteinu)
Expasy/ProtParam: umožňuje výpočet vícero různých vlastností proteinové sekvence.
Predikce štěpení proteasami
PeptideCutter je nástroj, který umožňuje simulovat štěpení proteinu vybranými proteasami.