• Neznámou sekvenci vložte do některého z programů pro predikci domén, např CD.
  • V programu BLAST (protein) vyhledejte podobné sekvence.

Při zadávání si zkontrolujte zda nemáte "omezené" hledání jen na člověka - pole by mělo zůstat prázdné a pro hledání organismu z jakého neznámá sekvence pochází je nutné prohledávat databázi "non-redundant protein sequences"

V%C3%BDst%C5%99i%C5%BEek4.PNG

Organismus, ze kterého tato sekvence pochází bude mít 100% shodnou sekvenci (bude to první odkaz).

  • Transmembránové úseky v této sekvenci hledejte některým z příslušných programů, např TMHMM.

Řešení.

Последнее изменение: понедельник, 3 апреля 2017, 09:01