DÚ5: Vyhledávání nukleotidových sekvencí
Požadavky na absolvování
Otevřené: pondělí, 10. března 2025, 17.00
Termín: čtvrtek, 27. března 2025, 17.00
1)Vyhledejte si vaši nukleotidovou sekvenci transkriptu (mRNA=RefSeq_transcript) a genu (RefSeq_gene).
◦Zapište si přístupové kódy. (NM_... a NG_...)
◦Jak dlouhé jsou tyto sekvence ? (stačí 1. transkript, máte-li více)
2)Vyberte pouze kódující sekvenci (CDS), uložte formát fasta.
3)Na kterém chromozomu leží? Kolik má exonů? Jak je dlouhý 2. exon? Stáhněte sekvenci 2. exonu.
4)Existuje nějaká souvislost vašeho genu v OMIM databázi?
5)Kolik obsahuje 2. exon Cytosinů? Kolik dinukleotidů CG?